{ "annotations": { "IUPAC": { "Fuc": [ "2", "4" ], "Gal": [ "3" ], "GalNAc": [ "5" ], "GlcNAc": [ "1" ], "Hex": [ "3" ], "HexNAc": [ "1", "5" ], "dHex": [ "2", "4" ] }, "MotifAlignments": { "CCRC.000001": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "CCRC.000018": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "CCRC.000019": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "CCRC.000038": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "CCRC.000039": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "CCRC.000045": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "CCRC.000048": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GD.R000003": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GD.R000053": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GD.R000069": [ "5", "5.1" ], "GD.R000080": [ "2", "4" ], "GD.R000088": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GD.R000114": [ "3" ], "GD.R000144": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GD.R000164": [ "5", "5.1" ], "GD.R000186": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GD.R000253": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GD.R000266": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GD.R000275": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GD.R000301": [ "3", "4", "3-4" ], "GD.R000319": [ "3" ], "GD.R000320": [ "3", "4", "3-4" ], "GD.R000322": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GD.R000347": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GD.R000359": [ "1", "1.1", "2", "1-2" ], "GD.R000364": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GD.R000373": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GD.R000388": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GD.R000480": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GD.R000486": [ "1", "1.1" ], "GD.R000501": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GD.R000518": [ "3", "4", "3-4" ], "GD.R000524": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GD.R000525": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDB.002122": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDB.002124": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GDB.002126": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDB.002141": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GDB.002173": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GDB.002189": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDB.002277": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GDB.002280": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDB.002286": [ "1", "1.1", "2", "1-2" ], "GDB.002292": [ "1", "1.1" ], "GDB.002293": [ "1", "1.1" ], "GDB.002359": [ "5", "5.1" ], "GDB.002370": [ "1", "1.1" ], "GDB.002371": [ "1", "1.1" ], "GDB.002765": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GDB.002771": [ "1", "1.1" ], "GDB.002772": [ "1", "1.1" ], "GDB.002788": [ "1", "1.1" ], "GDB.002804": [ "1", "1.1" ], "GDC.000001": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GDC.000018": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GDC.000019": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDC.000038": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDC.000039": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDC.000045": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDC.000048": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDH.000021": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GDH.000024": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDH.000025": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDH.000029": [ "3", "4", "3-4" ], "GDH.000031": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GDH.000099": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GDH.000100": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDH.000165": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GDH.000166": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GDH.000167": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GDH.000169": [ "3", "4", "3-4" ], "GDH.000170": [ "3", "4", "3-4" ], "GDH.000172": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GDH.000173": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDSB.000007": [ "3" ], "GDSB.000030": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GDSB.000034": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GDSB.000036": [ "5", "5.1" ], "GDSB.000061": [ "1", "1.1" ], "GDSB.000086": [ "2", "4" ], "GDSB.000088": [ "3" ], "GDSB.000147": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDSB.000149": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GDSB.000154": [ "3", "4", "3-4" ], "GDSB.000165": [ "3" ], "GDSB.000166": [ "3" ], "GDSB.000187": [ "3" ], "GDSB.000195": [ "3" ], "GDV.000012": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDV.000013": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDV.000014": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GDV.000038": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GDV.000046": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GDV.000059": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GDV.000060": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GE.EP0004": [ "1", "1.1" ], "GE.EP0011": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GE.EP0018": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GE.EP0250": [ "3", "4", "3-4" ], "GE.EP0252": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GE.EP0255": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GE.EP0257": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GE.EP0261": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GE.EP0506": [ "3" ], "GE.EP0507": [ "3" ], "GGM.000001": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GGM.000018": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GGM.000019": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GGM.000036": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GGM.000038": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GGM.000039": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GGM.000045": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GM.G00051MO": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GM.G00052MO": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GM.G00055MO": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GM.G00066MO": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GM.G00068MO": [ "3", "4", "3-4" ], "GM.G01187XC": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GM.G10902TC": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GM.G17108EX": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GM.G20009SF": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GM.G24566OP": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GM.G27025MB": [ "5", "5.1" ], "GM.G33888AF": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GM.G39064VB": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GM.G47428UI": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GM.G49108TO": [ "1", "1.1" ], "GM.G49963IQ": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GM.G51331BY": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GM.G54826OZ": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GM.G55958KV": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GM.G57321FI": [ "5", "5.1" ], "GM.G61459JW": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "GM.G64581RP": [ "1", "1.1" ], "GM.G65889KE": [ "3" ], "GM.G66086EX": [ "3", "4", "3-4" ], "GM.G68158BT": [ "3" ], "GM.G69386QK": [ "3" ], "GM.G74353FF": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "GM.G77076MY": [ "3" ], "GM.G80587NA": [ "1", "1.1", "2", "1-2" ], "GM.G82576YO": [ "2", "4" ], "GM.G82749ZI": [ "3", "4", "3-4" ], "GTC.G00051MO": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "GTC.G00052MO": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "GTC.G00055MO": [ "1", "1.1", "3", "1-3" ], "GTC.G00066MO": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "GTC.G00068MO": [ "3", "4", "3-4" ], "UCM.000021": [ "3", "4", "5", "5.1", "3-4", "3-5" ], "UCM.000024": [ "1", "1.1", "3", "4", "5", "5.1", "1-3", "3-4", "3-5" ], "UCM.000025": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "5", "5.1", "1-2", "1-3", "3-4", "3-5" ], "UCM.000029": [ "3", "4", "3-4" ], "UCM.000031": [ "1", "1.1", "3", "4", "1-3", "3-4" ], "UCM.000099": [ "1", "1.1", "2", "3", "1-2", "1-3" ], "UCM.000100": [ "1", "1.1", "2", "3", "4", "1-2", "1-3", "3-4" ], "UCM.000128": [ "1", "1.1" ] } }, "canonical_sequence_accession": "G09877KN", "canonical_sequence_md5": "4523bb8e8858eb52636dc8b319ccb43c", "residuemap": { "1": [ "r-1:2" ], "1-2": [ "l-1:2,3" ], "1-3": [ "l-1:2,4" ], "2": [ "r-1:3" ], "3": [ "r-1:4" ], "3-4": [ "l-1:4,5" ], "3-5": [ "l-1:4,6" ], "4": [ "r-1:5" ], "5": [ "r-1:6" ] }, "residues": [ { "absolute": "D", "monodb": "x-dglc-HEX-x:x||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GlcNAc", "residueid": "1", "residuetype": "monosaccharide" }, { "absolute": "L", "monodb": "x-lgal-HEX-1:5|6:d", "name": "Fuc", "parentid": "1", "residueid": "2", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p", "site": "3" }, { "absolute": "D", "anomer": "b", "monodb": "b-dgal-HEX-1:5", "name": "Gal", "parentid": "1", "residueid": "3", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p", "site": "4" }, { "absolute": "L", "anomer": "a", "monodb": "a-lgal-HEX-1:5|6:d", "name": "Fuc", "parentid": "3", "residueid": "4", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p", "site": "2" }, { "absolute": "D", "anomer": "a", "monodb": "a-dgal-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GalNAc", "parentid": "3", "residueid": "5", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p", "site": "3" } ], "svg_sequence_md5": "1f158248e9e10b5009d9f31863f9bc0c" }