{ "annotations": { "IUPAC": { "GalNAc": [ "6", "10" ], "GlcNAc": [ "1", "2", "5", "7", "9", "11" ], "Hex": [ "3", "4", "8" ], "HexNAc": [ "1", "2", "5", "6", "7", "9", "10", "11" ], "Man": [ "3", "4", "8" ] }, "MotifAlignments": { "CCRC.000016": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GD.R000024": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GD.R000069": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GD.R000084": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GD.R000163": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GD.R000164": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GD.R000177": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GD.R000198": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GD.R000234": [ "2", "2.1", "3", "4", "8", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GD.R000245": [ "3", "4", "8" ], "GD.R000297": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "1-2" ], "GD.R000323": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GD.R000353": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GD.R000374": [ "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GD.R000395": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GD.R000445": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "6", "6.1", "8", "9", "9.1", "10", "10.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "5-6", "8-9", "9-10" ], "GD.R000486": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GD.R000541": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GD.R000546": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GDB.002292": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDB.002293": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDB.002304": [ "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GDB.002322": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "6", "6.1", "8", "9", "9.1", "10", "10.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "5-6", "8-9", "9-10" ], "GDB.002337": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GDB.002338": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GDB.002339": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GDB.002359": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GDB.002370": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDB.002371": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDB.002771": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDB.002772": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDB.002779": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GDB.002780": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GDB.002788": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDB.002804": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GDC.000016": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GDH.000088": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GDSB.000009": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GDSB.000033": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GDSB.000036": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GDSB.000044": [ "3", "4", "8" ], "GDSB.000061": [ "1", "1.1" ], "GDSB.000067": [ "3", "4", "8" ], "GDSB.000072": [ "3", "4", "8" ], "GDSB.000073": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GDSB.000074": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "1-2" ], "GDSB.000085": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "1-2" ], "GDSB.000136": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GDV.000074": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GE.EP0004": [ "1", "1.1" ], "GE.EP0150": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GGM.000016": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GGM.001001": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GGM.001004": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GGM.001027": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GGM.001037": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GGM.001038": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GGM.001039": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GGM.001041": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GM.G00026MO": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GM.G00030MO": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GM.G00057MO": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GM.G00619DD": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GM.G07490EK": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GM.G07982RO": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "1-2" ], "GM.G09820LN": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GM.G17780OR": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GM.G19266OP": [ "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GM.G20624LQ": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GM.G22768VO": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GM.G27025MB": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GM.G29313LW": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GM.G31736BK": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "GM.G33451SJ": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GM.G35698AZ": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GM.G49108TO": [ "1", "1.1" ], "GM.G51379UR": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GM.G57321FI": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GM.G59096WE": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GM.G59883YF": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GM.G61418DU": [ "6", "6.1", "10", "10.1" ], "GM.G64581RP": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "5", "5.1", "7", "7.1", "9", "9.1", "11", "11.1" ], "GM.G70323CJ": [ "3", "4", "8" ], "GM.G72618IM": [ "3", "4", "8", "3-4", "3-8" ], "GM.G76297JC": [ "2", "2.1", "3", "4", "8", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GM.G98066UT": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "6", "6.1", "8", "9", "9.1", "10", "10.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "5-6", "8-9", "9-10" ], "GM.G98414DB": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GTC.G00026MO": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "8", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8" ], "GTC.G00030MO": [ "1", "1.1", "2", "2.1", "3", "4", "5", "5.1", "7", "7.1", "8", "9", "9.1", "11", "11.1", "1-2", "2-3", "3-4", "3-8", "4-5", "4-7", "8-9", "8-11" ], "GTC.G00057MO": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "UCM.000088": [ "5", "5.1", "6", "6.1", "9", "9.1", "10", "10.1", "5-6", "9-10" ], "UCM.000128": [ "1", "1.1" ] } }, "canonical_sequence": "WURCS=2.0/3,11,10/[a2122h-1x_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1x_1-5][a2112h-1x_1-5_2*NCC/3=O]/1-1-2-2-1-3-1-2-1-3-1/a?-b1_b?-c1_c?-d1_c?-h1_d?-e1_d?-g1_e?-f1_h?-i1_h?-k1_i?-j1", "canonical_sequence_accession": "G05884CO", "canonical_sequence_md5": "b85817a56e7cbdc1c722a4ba84870288", "residuemap": { "1": [ "r-1:2" ], "1-2": [ "l-1:2,3" ], "10": [ "r-1:12" ], "11": [ "r-1:11" ], "2": [ "r-1:3" ], "2-3": [ "l-1:3,4" ], "3": [ "r-1:4" ], "3-4": [ "l-1:4,5" ], "3-8": [ "l-1:4,6" ], "4": [ "r-1:5" ], "4-5": [ "l-1:5,7" ], "4-7": [ "l-1:5,8" ], "5": [ "r-1:7" ], "5-6": [ "l-1:7,9" ], "6": [ "r-1:9" ], "7": [ "r-1:8" ], "8": [ "r-1:6" ], "8-11": [ "l-1:6,11" ], "8-9": [ "l-1:6,10" ], "9": [ "r-1:10" ], "9-10": [ "l-1:10,12" ] }, "residues": [ { "absolute": "D", "monodb": "x-dglc-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GlcNAc", "residueid": "1", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dglc-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GlcNAc", "parentid": "1", "residueid": "2", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dman-HEX-1:5", "name": "Man", "parentid": "2", "residueid": "3", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dman-HEX-1:5", "name": "Man", "parentid": "3", "residueid": "4", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dglc-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GlcNAc", "parentid": "4", "residueid": "5", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dgal-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GalNAc", "parentid": "5", "residueid": "6", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dglc-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GlcNAc", "parentid": "4", "residueid": "7", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dman-HEX-1:5", "name": "Man", "parentid": "3", "residueid": "8", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dglc-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GlcNAc", "parentid": "8", "residueid": "9", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dgal-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GalNAc", "parentid": "9", "residueid": "10", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" }, { "absolute": "D", "monodb": "x-dglc-HEX-1:5||(2d:1n)n-acetyl", "name": "GlcNAc", "parentid": "8", "residueid": "11", "residuetype": "monosaccharide", "ring": "p" } ], "svg_sequence_md5": "06c36cec98c01f34e1f281bc24431226" }