{ "bcoid": "GLY_000621", "title": "Glycan monosaccharide advanced compositions", "description": "The dataset provides the monosaccharide compositions for the associated glycans (GlyTouCan Accession). ...", "filename": "glycan_monosaccharide_composition_advanced.csv", "filetype": "csv", "categories": { "molecule": [ "Glycan" ], "tag": [ "Monosaccharide composition" ], "status": [ "Reviewed" ], "file_type": [ "csv" ], "scope": [ "internal" ], "species": [ "Mus musculus", "Homo sapiens", "Sus scrofa", "Saccharomyces cerevisiae", "Rattus norvegicus", "Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2", "Rattus", "Drosophila melanogaster", "Hepacivirus C", "Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus", "Hepatitis C virus (isolate H)", "Sus scrofa domesticus", "Dictyostelium discoideum" ] }, "minitable": { "content": [ [ "G76100HQ...", "0..." ], [ "G05834TJ...", "1..." ] ], "headers": [ "glytoucan_ac...", "Fuc..." ], "colwidth": [ "40%", "20%" ] }, "sampledata": { "type": "table", "data": [ [ { "type": "string", "label": "glytoucan_ac" }, { "type": "string", "label": "Fuc" }, { "type": "string", "label": "Fuc+aldi" }, { "type": "string", "label": "Gal" }, { "type": "string", "label": "Gal+aldi" }, { "type": "string", "label": "GalA" }, { "type": "string", "label": "GalNAc" }, { "type": "string", "label": "GalNAc+aldi" }, { "type": "string", "label": "Glc" }, { "type": "string", "label": "Glc+aldi" }, { "type": "string", "label": "GlcA" }, { "type": "string", "label": "GlcN" }, { "type": "string", "label": "GlcNAc" }, { "type": "string", "label": "GlcNAc+aldi" }, { "type": "string", "label": "Hex" }, { "type": "string", "label": "Hex+aldi" }, { "type": "string", "label": "HexA" }, { "type": "string", "label": "HexN" }, { "type": "string", "label": "HexNAc" }, { "type": "string", "label": "HexNAc+aldi" }, { "type": "string", "label": "IdoA" }, { "type": "string", "label": "Kdn" }, { "type": "string", "label": "Man" }, { "type": "string", "label": "Man+aldi" }, { "type": "string", "label": "ManNAc" }, { "type": "string", "label": "Me" }, { "type": "string", "label": "NeuAc" }, { "type": "string", "label": "NeuGc" }, { "type": "string", "label": "P" }, { "type": "string", "label": "Pent" }, { "type": "string", "label": "S" }, { "type": "string", "label": "Sia" }, { "type": "string", "label": "X" }, { "type": "string", "label": "Xxx" }, { "type": "string", "label": "Xyl" }, { "type": "string", "label": "aldi" }, { "type": "string", "label": "dHex" }, { "type": "string", "label": "dHex+aldi" }, { "type": "string", "label": "Count" } ], [ "G76100HQ", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "1", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G05834TJ", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "4", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "8" ], [ "G22196LK", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "3", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "9" ], [ "G27946NT", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "5", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "9" ], [ "G57976DO", "2", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "5", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "12" ], [ "G87755UZ", "3", "0", "5", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "5", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "12" ], [ "G95016HS", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2" ], [ "G67583XR", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "7" ], [ "G91636VS", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "11" ], [ "G87581UC", "1", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "2", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "1", "1", "0", "5" ], [ "G79026TT", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "15" ], [ "G48400DU", "1", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "7" ], [ "G79379XF", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2" ], [ "G55459MJ", "0", "0", "4", "0", "0", "1", "1", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "4", "0", "0", "0", "4", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "8" ], [ "G33734YD", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "4", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "8" ], [ "G80565EC", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2" ], [ "G02335DL", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "14" ], [ "G48472LJ", "2", "0", "4", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "4", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "10" ], [ "G64828QT", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6", "0", "9", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "20" ], [ "G96934US", "0", "0", "1", "0", "0", "1", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "5" ], [ "G37719FP", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "8" ], [ "G03678BK", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3" ], [ "G09173AD", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6", "0", "7", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "15" ], [ "G04165ZA", "0", "0", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G69053FP", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G74316CK", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "10", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "10", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "11" ], [ "G03459AF", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "6", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "8" ], [ "G58042JX", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6" ], [ "G63527PL", "1", "0", "1", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "4" ], [ "G59345UT", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "14" ], [ "G56339QG", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "12" ], [ "G80364WF", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "4", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "11" ], [ "G39256XF", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "15" ], [ "G25531CZ", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G27761LM", "1", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "3", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "9" ], [ "G24634JN", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "4", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "12" ], [ "G17218WW", "0", "0", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "2", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G92855TK", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "12" ], [ "G59456VR", "1", "0", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "5", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "12" ], [ "G30404JO", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "7", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "18" ], [ "G43638GS", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "8" ], [ "G12417OE", "0", "0", "1", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "4", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "9" ], [ "G39632CM", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6" ], [ "G91451KI", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "6", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "10" ], [ "G36847DS", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "15" ], [ "G44094CZ", "0", "0", "3", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "7" ], [ "G55786MG", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "8", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "8", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "10" ], [ "G84168WH", "0", "0", "3", "0", "0", "1", "1", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "6" ], [ "G24823MG", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "14" ], [ "G18574CV", "0", "0", "1", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G08597BP", "4", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6", "0", "6", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "16" ], [ "G93389TU", "1", "0", "1", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "5" ], [ "G05463IO", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3" ], [ "G19282BU", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "4", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "9" ], [ "G58186QM", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "11", "0", "0", "0", "11", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "23" ], [ "G17593CN", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "1", "6", "0", "0", "0", "5", "1", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "15" ], [ "G99580PT", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5" ], [ "G47870LR", "1", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "5", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "11" ], [ "G73157FZ", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "3" ], [ "G12707TR", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G41655EF", "2", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "5", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "12" ], [ "G67776GW", "1", "0", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "2", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "6" ], [ "G62707LQ", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "8" ], [ "G36807NH", "0", "0", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "2", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6" ], [ "G60365DR", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "1", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "3" ], [ "G38979OV", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "2" ], [ "G72011DH", "1", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "5", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "12" ], [ "G23909UE", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "1", "0", "0", "0", "0", "2", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "2" ], [ "G97625RT", "1", "0", "4", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "7", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "14" ], [ "G29288DT", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "11", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "11", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "13" ], [ "G04348PK", "1", "0", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "5", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "12" ], [ "G79365EN", "2", "0", "4", "0", "0", "2", "0", "1", "0", "0", "0", "2", "0", "5", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "11" ], [ "G13091NP", "1", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "6", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "13" ], [ "G99522JL", "2", "0", "2", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "2", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "7" ], [ "G96919WB", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6", "0", "5", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "11" ], [ "G25953KD", "0", "0", "2", "0", "0", "2", "1", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "2", "0", "0", "0", "5", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "7" ], [ "G57522BR", "3", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "6", "0", "7", "0", "0", "0", "6", "0", "0", "0", "3", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "17" ], [ "G74474VF", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "2", "0", "0", "0", "0", "1", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "0", "4" ], [ "G79776YU", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "4", "0", "5", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "11" ], [ "G25451PN", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "5", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "3", "0", "12" ], [ "G79982KZ", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "4" ], [ "G10440YK", "1", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "2", "0", "4", "0", "0", "0", "2", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "7" ], [ "G31544HA", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "8", "0", "0", "0", "7", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "1", "0", "16" ], [ "G64766UZ", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "0", "4" ] ] }, "readme": "Name\n - Glycan monosaccharide advanced compositions\n\nVersion\n - v-2.4.1\n\nCreated on\n - 2022-03-10T15:38:14.531948\n\nModified on\n - 2022-09-26T09:08:12.723112\n\nCreated by\n - Karina Martinez [karinamartinez@gwu.edu], Luke Johnson [luke.johnson@email.gwu.edu], Urnisha Bhuiyan [sbhuiyan28@email.gwu.edu], Cyrus Au-Yeung [cyruschauyeung@gwu.edu], Jingyue Wu [jingyue.wu@email.gwu.edu]\n\nAuthors\n - Nathan Edwards []\n\nChecksum\n - \n\nUsability Domain\n - The dataset provides the monosaccharide compositions for the associated glycans (GlyTouCan Accession). It provides the count for sugar residues such as Hexose (Hex), N-Acetylhexosamine (HexNAc), Deoxyhexose (dHex), N-Acetylneuraminic Acid ( NeuAc), N-Glycolylneuraminic Acid (NeuGc), Other (Xxx). The listed GlyTouCan Accessions are derived from the GlyTouCan accession master list (https://data.glygen.org/GLYDS000281). Source database: https://glytoucan.org/\n\nDescription Domain\n Keywords\n - Glycan\n - GlyTouCan accession\n - Monosaccharide composition\n\n Pipeline Steps\n - Step-1: The input file was downloaded from the author and a python script is used to extract the data for the GlyTouCan accessions based on the accession master list. Refer to the usability domain for more information on master list\n\nExecution Domain\n Scripts - https://github.com/glygener/glygen-backend-integration/blob/master/dataset-maker/make-species-agnostic-dataset.py\n\n\n Software Prerequisites\n Name: Python\n Version: 2.7.5\n URI: https://www.python.org/download/releases/2.7.5/\n\nI/O Domain\n Input Subdomain\n Name: glycan_masterlist.csv\n URI: https:/data.glygen.org/ln2releases/data/v-2.4.1/reviewed/glycan_masterlist.csv\n Name: monocounts.tsv\n URI: https:/data.glygen.org/ln2downloads/glytoucan/gtc_02_20_2024/export/monocounts.tsv\n Output Subdomain\n Name: glycan_monosaccharide_composition_advanced.csv\n URI: https:/data.glygen.org/ln2releases/data/v-2.4.1/reviewed/glycan_monosaccharide_composition_advanced.csv\n Name: glycan_monosaccharide_composition_advanced.stat.csv\n URI: https:/data.glygen.org/ln2releases/data/v-2.4.1/reviewed/glycan_monosaccharide_composition_advanced.stat.csv\n\nFields\n Name: \"glytoucan_ac\"\n Description: \"Unique accession assigned to the registered glycan structure in GlyTouCan database\"\n Unique Values: \"47575\"\n Name: \"Fuc\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"9\"\n Name: \"Fuc+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"Gal\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"14\"\n Name: \"Gal+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"GalA\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"3\"\n Name: \"GalNAc\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"7\"\n Name: \"GalNAc+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"Glc\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"10\"\n Name: \"Glc+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"GlcA\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"6\"\n Name: \"GlcN\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"5\"\n Name: \"GlcNAc\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"16\"\n Name: \"GlcNAc+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"Hex\"\n Description: \"Abbreviation for Hexose monosaccharide residue\"\n Unique Values: \"20\"\n Name: \"Hex+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"HexA\"\n Description: \"Abbreviation for Hexuronic Acid monosaccharide residue\"\n Unique Values: \"6\"\n Name: \"HexN\"\n Description: \"Abbreviation for 2-Amino-2-Deoxy-Hexose monosaccharide residue\"\n Unique Values: \"5\"\n Name: \"HexNAc\"\n Description: \"Abbreviation for N-Acetylhexosamine monosaccharide residue\"\n Unique Values: \"16\"\n Name: \"HexNAc+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"IdoA\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"4\"\n Name: \"Kdn\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"Man\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"18\"\n Name: \"Man+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"ManNAc\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"Me\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"NeuAc\"\n Description: \"Abbreviation for N-Acetylneuraminic Acid monosaccharide residue\"\n Unique Values: \"8\"\n Name: \"NeuGc\"\n Description: \"Abbreviation for N-Glycolylneuraminic Acid monosaccharide residue\"\n Unique Values: \"6\"\n Name: \"P\"\n Description: \"Abbreviation for Phosphate\"\n Unique Values: \"4\"\n Name: \"Pent\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"3\"\n Name: \"S\"\n Description: \"Abbreviation for Sulphate\"\n Unique Values: \"13\"\n Name: \"Sia\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"8\"\n Name: \"X\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"4\"\n Name: \"Xxx\"\n Description: \"Denotes other monosaccharide residues \"\n Unique Values: \"6\"\n Name: \"Xyl\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"3\"\n Name: \"aldi\"\n Description: \"Abbreviation for alditol\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"dHex\"\n Description: \"Abbreviation for Deoxyhexose monosaccharide residue\"\n Unique Values: \"9\"\n Name: \"dHex+aldi\"\n Description: \"\"\n Unique Values: \"2\"\n Name: \"Count\"\n Description: \"Number of monosaccharide residues in a glycan\"\n Unique Values: \"34\"", "downloadurl": "/ln2data/releases/data/v-2.4.1/reviewed/glycan_monosaccharide_composition_advanced.csv" }